Moin Micha,
ja, und immer wieder die Ratschläge: Neuinstallieren und nochmals Neuinstallieren und …
Mittlerweile Standard IT / EDV Sprichwort: „Die Definition von Wahnsinn ist, immer wieder das Gleiche tun und dann andere Ergebnisse erwarten“. 
Also, nicht mehr neu Installieren, sondern versuchen wir erst einmal den kausalen Zusammenhang zu finden.
Die Steinberg „MediaBay3.DB“ ist die zentrale Datenbank für alles was Du, z.B. unter CUBASE bei Aufruf über F5 MediaBay, angezeigt bekommst. Die Datenbank steht normalerweise unter:
“C:\Users\“DeinUserName“\AppData\Local\Steinberg\Steinberg MediaBay Server”
mit dem Dateinamen: “mediabay3.db”
Je nach Einstellung wird dazu von Cubase Dein Dateisystem gescannt. Was gescannt werden soll lässt sich unter Cubase in der MediaBay in der linke Zone einstellen.
Dein Effekt entsteht, weil es in deiner MediaBay zum dem Preset „!Reset EQ“ zwei Einträge mit unterschiedlichen GUID’s (das ist der langen Zahlen.-Buchstabensalat “C5D59066D5744F57BD20B37643A5E119”) gibt.
Der erste Eintrag: (dein erstes Bild)
„vstsound://C5D59066D5744F57BD20B37643A5E119/VST3 Presets/Steinberg Media Technologies/EQ/!Reset EQ.vstpreset“ ist der Richtige.
So sieht dann der passende Datensatz in der (meiner) MediaBay aus.
(Das ist ein seperates Tool, mit der man in die Steinberg Datenbank schauen kann)
Bedeutet, auf Deinem Rechner befindet sich noch ein zweites Preset mit dem gleichen Namen, aber mit einer anderen GUID. Siehe dazu Dein zweites Bild. Die dazugehörige Datei(en) gilt es zu finden und zu löschen. Danach die MediaBay neu scannen und dann sollte der Eintrag verschwunden sein.
Wo sich dieses verwaiste Preset bei Dir befindet, kann ich Dir leider nicht sagen. Normalerweise stehen die Default Teile unter „C:\Program Files\Steinberg\Cubase 15\VST3\Cubase Plug-in Set.vst3\Contents\Resources\VST XMLs“. Die Steinberg Verzeichnis Struktur, auf dem Windows-Dateisystem, ist aber leider nicht so einfach zu verstehen. Nur wer suchet, der findet. 
@ Steinberg: Schreibt doch bitte, bei dem ganzen “Content und Preset Zeug’s”, den dazugehörigen „absoluten Datei-Pfad“ mit in die Datenbank. Das wäre super und damit könnten doppelte Einträge in der DB leichter beseitigt werden. Das passiert ja augenscheinlich, bei etlichen Cubase Benutzern, immer wieder.
Die Welt könnte so einfach sein.
LG
Mike aus dem Ruhrgebiet