Hallo Andreas,
Das klingt nach einem größeren Problem, welches meiner Meinung nach aber weniger mit Cubase zusammen hängt. Hier gibt es viele Informationen mit vielen Empfehlungen, wie Du deinen PC konfigurieren solltest, damit es sauber läuft. Schau mal rein, vielleicht hilft es Dir weiter.
mw
Edit:
Hier noch ein PDF-Dokument mit wirklich sehr guten Ratschlägen, zum Optimieren seines Windows 7 PC.
http://www.timos-welt.de/win7/Windows_7_PC_als_DAW_optimieren.pdf