Ich habe jetzt einmal ein bisschen zu Deiner Fehlermeldung im Forum recherchiert. Es gibt etliche Beiträge dazu … und jedem hat etwas anderes geholfen. 
Wie gut ist Dein Englisch? Ich verlinke einmal die Beiträge:
HIER haben einige das von Dir beschriebene Problem. Das Interessante: Sie nutzen ebenfalls ein Audio-Interface von Focusrite. Dort hat es einigen geholfen, wenn sie den ASIO-Treiber noch einmal neu installiert haben.
In einigen Beiträgen habe ich gelesen, dass manche Nutzer das Problem dadurch lösen konnten, indem sie Cubase einfach als Administrator starten.
Bei anderen lag es an der Festplatte, so wie in DIESEM Beitrag.
Und bei manchen Nutzern lag es an einer korrupten Projektdatei. Nachdem sie ein komplett neues Projekt angelegt haben, funktionierte es wieder mit der Aufnahme.
Ich würde Dir empfehlen, es zunächst einmal mit den “einfachen” Dingen zu probieren: 1. Programm als Admin starten. 2. Ein neues Projekt anlegen und testen, ob es damit klappt. Sowie 3. den ASIO-Treiber für Dein Focusrite-Interface neu zu installieren.
Vielleicht löst eine dieser Vorgehensweisen Dein Problem.
(Wäre schön, wenn es reichen würde, Cubase nur als Admin zu starten. Dann bräuchtest Du nicht weiter nach der Ursache zu suchen. 
Tatsächlich konnte ich selbst schon manches Problem dadurch lösen, dass ich ein Programm mit Administrator-Rechten gestartet habe. Aber ich kann Dir natürlich nicht versprechen, dass es auch bei Dir klappt. Cubase sollte normalerweise auch ohne diese Rechte seine Arbeit verrichten.)