In Akkordspur Auswahl von C#, Name des Parts: Db
Problem Enharmonische Verwechslung in Akkordspur gelöst (ziemlich umständlich) .
Noten in Midispur mittels Akkordspur erzeugt (Namen der Parts sind wieder falsch).
In Notation Akkorde erzeugt.
Akkorde sind wieder enharmonisch verwechselt.
Muss ich nun jedes dieser Akkordsymbole manuell anpassen, oder gibt es bessere Möglichkeiten? 
Da man Deine Vorgehensweise nur wage erahnen kann, lassen sich Deine Fragen schlecht beantworten.
Für die enharmonische Verwechslung gibt es sowohl im Projektfenster als auch im MIDI-Key-Editor und im Noteneditor separate Funktionen.
Im Noteneditor entscheidet die eingestellte Tonart, ob ein # oder b angezeigt wird. Wobei man das für jede Note manuell ändern kann.
“Noten in Midispur mittels Akkordspur erzeugt (Namen der Parts sind wieder falsch).”
Meinst Du mit den Parts in der MIDI-Spur, die angeblich falsche Namen bekommen, MIDI-Events im Key-Editor?
Für diese kann man zwar die Tonhöhe als Notennamen anzeigen lassen, z.B. G#2, aber an dieser Stelle gibt es keine enharmonische Auswahlmöglichkeit (die Anzeige dient nur zur Orientierung).
“In Notation Akkorde erzeugt. Akkorde sind wieder enharmonisch verwechselt.”
Im Dialogfenster für die Akkordsymboleingabe gibt es eine Auswahlbox “Enh. Verwechslung”.
Gruß
PAT